Die SHK ist das oberste hochschulpolitische Organ der Schweiz, in welchem der Bund und die Kantone gemeinsam für die Koordination im schweizerischen Hochschulwesen sorgen, wie zum Beispiel in den Gebieten der Zulassungen, Qualitätssicherung, Beiträge und nationale Strategien der Hochschulen. Die SHK wird von der Bundesrätin und Vorsteherin oder dem Bundesrat und Vorsteher des Departements für Wirtschaft, Bildung und Forschung (WBF) präsidiert. Die zwei Vizepräsidentinnen oder Vizepräsidenten sind Vertreterinnen oder Vertreter der Kantone, wobei immer eine oder einer aus Deutschschweiz und die oder der andere aus der lateinischen Schweiz gewählt wird.
Als Vizepräsidentin der SHK wird Frau Bonvin-Sansonnens gleichzeitig im Vorstand der Schweizerischen Konferenz der kantonalen Erziehungsdirektorinnen und -direktoren (EDK) eintreten. Die EDK ist verantwortlich für die nationale Koordination in der Bildungs- und Kulturpolitik, dazu gehören Aufgaben wie die Harmonisierung der obligatorischen Schulen, die Anerkennung der Abschlüsse der Sekundarstufe II und der Hochschuldiplome der Lehrpersonen und die Freizügigkeitsvereinbarungen, welche den gleichberechtigten Zugang zu Bildungsinstitutionen in der ganzen Schweiz ermöglichen.