Es ist zuständig für die Bekämpfung übertragbarer Krankheiten und beteiligt sich an der Aufsicht über die Gesundheitsfachpersonen und die Institutionen. Ausserdem koordiniert es die schulärztliche Betreuung und das Betreuungsangebot im Suchtbereich.
Die Freiburger Fachstelle für sexuelle Gesundheit gehört zum KAA und erteilt den Schülerinnen und Schülern Freiburgs während der obligatorischen Schulzeit Sexualkundeunterricht.
Das KAA steuert ferner den Sanitätsbereich für den Bevölkerungsschutz in ausserordentlichen Situationen.
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