Elle est responsable de l’application des inventaires fédéraux (paysages, bas-marais, hauts-marais, sites marécageux, zones alluviales, prairies et pâturages secs, sites de reproduction de batraciens) et cantonaux en matière de protection de la nature. Elle préavise également un nombre important de dossiers de construction.
La gestion des réserves naturelles est également de son ressort, tout comme le domaine de la compensation écologique. Un nombre important d'agriculteurs bénéficient également d'un contrat LPN pour l'exploitation appropriée de biotopes sensibles comme les prairies maigres ou les bas-marais.